Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSPB3Q12988 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSPB3Q12988 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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