Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GRIN2AQ12879 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIN2AQ12879 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
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