Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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FAM27E3Q08E93 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FAM27E3Q08E93 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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FAM27E3Q08E93 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FAM27E3Q08E93 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
FAM27E3Q08E93 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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