Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SSRP1Q08945 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms