Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TFF3Q07654 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TFF3Q07654 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TFF3Q07654 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms