Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL9Q07325 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms