Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN11Q06124 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms