Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTDSPL2Q05D32 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTDSPL2Q05D32 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms