Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALD1Q05682 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms