Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ARID5AQ03989 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARID5AQ03989 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms