Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ERCC6Q03468 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ERCC6Q03468 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms