Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POU3F1Q03052 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms