Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCNT1Q02742 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms