Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DSG1Q02413 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSG1Q02413 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms