Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TNFRSF17Q02223 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms