Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PLCB3Q01970 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms