Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
OTUD4Q01804 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
OTUD4Q01804 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms