Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms