Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCN7AQ01118 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms