Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLTCQ00610 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLTCQ00610 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms