Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FGD1P98174 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FGD1P98174 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FGD1P98174 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms