Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRB1P82279 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CRB1P82279 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CRB1P82279 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CRB1P82279 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CRB1P82279 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CRB1P82279 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms