Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P63132 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms