Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
HERVK_113P63121 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms