Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB1AP62820 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms