Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN15P56746 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms