Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME5P56597 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME5P56597 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME5P56597 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME5P56597 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME5P56597 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms