Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAV3P56539 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms