Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PGGT1BP53609 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PGGT1BP53609 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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