Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1P51787 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms