Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GDI2P50395 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GDI2P50395 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GDI2P50395 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms