Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GSK3BP49841 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GSK3BP49841 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms