Protein–RNA interactions for Protein: P47872

SCTR, Secretin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCTRP47872 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCTRP47872 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCTRP47872 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCTRP47872 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms