Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATRXP46100 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATRXP46100 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms