Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CAPGP40121 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPGP40121 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CAPGP40121 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPGP40121 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPGP40121 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPGP40121 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPGP40121 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms