Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM23P36406 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms