Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GPC1P35052 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GPC1P35052 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms