Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CMPK1P30085 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms