Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CASP1P29466 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP1P29466 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms