Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIFP27352 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIFP27352 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIFP27352 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIFP27352 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GIFP27352 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIFP27352 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIFP27352 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIFP27352 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms