Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NFKBIAP25963 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms