Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRPH2P23942 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRPH2P23942 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms