Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRDP23468 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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