Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF3P20783 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF3P20783 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NTF3P20783 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms