Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTLA4P16410 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CTLA4P16410 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms