Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DOBP13765 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms