Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RLBP1P12271 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RLBP1P12271 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms