Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT3P12035 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT3P12035 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms