Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHGAP10645 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHGAP10645 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHGAP10645 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHGAP10645 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHGAP10645 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHGAP10645 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHGAP10645 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms