Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RGPD2P0DJD1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RGPD2P0DJD1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms